Los pacientes con PKU son atendidos por un equipo de médicas y nutricionistas que supervisan periódicamente cómo están evolucionando de acuerdo a la edad. El equipo también está integrado por una psicopedagoga y una psicóloga.

Se controlan los valores de fenilalanina en el laboratorio de FEI y cada paciente debe presentar un registro de su alimentación del periodo a controlar. El registro es muy minucioso, para saber exactamente la cantidad de proteínas, calorías y otros nutrientes que tiene el paciente y así ajustar su tratamiento.